blosumG_20-20_70
# Rectangular BLOSUM Scoring Matrix 20x20 in 1/2 Bit Units
# Blocks Database = blocks.dat
# Cluster Percentage: >= 70
# Entropy = 0.8391, Expected = -0.6313
C F Y W M L I V G P A T S N H Q E D R K
C 9 -2 -3 -3 -2 -2 -1 -1 -3 -3 -1 -1 -1 -3 -4 -3 -4 -4 -4 -4
F -2 6 3 1 0 0 0 -1 -4 -4 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 -4 -3 -3
Y -3 3 7 2 -1 -1 -1 -2 -4 -3 -2 -2 -2 -2 2 -2 -3 -4 -2 -2
W -3 1 2 11 -2 -2 -3 -3 -3 -4 -3 -3 -3 -4 -2 -2 -4 -5 -3 -3
M -2 0 -1 -2 6 2 1 1 -3 -3 -1 -1 -2 -2 -2 0 -2 -3 -2 -2
L -2 0 -1 -2 2 4 2 1 -4 -3 -2 -2 -3 -4 -3 -2 -3 -4 -3 -3
I -1 0 -1 -3 1 2 4 3 -4 -3 -2 -1 -3 -4 -4 -3 -4 -4 -3 -3
V -1 -1 -2 -3 1 1 3 4 -4 -3 0 0 -2 -3 -3 -2 -3 -4 -3 -3
G -3 -4 -4 -3 -3 -4 -4 -4 6 -3 0 -2 -1 -1 -2 -2 -2 -2 -3 -2
P -3 -4 -3 -4 -3 -3 -3 -3 -3 8 -1 -1 -1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -1
A -1 -2 -2 -3 -1 -2 -2 0 0 -1 4 0 1 -2 -2 -1 -1 -2 -2 -1
T -1 -2 -2 -3 -1 -2 -1 0 -2 -1 0 5 1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -1
S -1 -3 -2 -3 -2 -3 -3 -2 -1 -1 1 1 4 0 -1 0 0 0 -1 0
N -3 -3 -2 -4 -2 -4 -4 -3 -1 -2 -2 0 0 6 0 0 0 1 -1 0
H -4 -1 2 -2 -2 -3 -4 -3 -2 -2 -2 -2 -1 0 8 1 0 -1 0 -1
Q -3 -3 -2 -2 0 -2 -3 -2 -2 -2 -1 -1 0 0 1 6 2 -1 1 1
E -4 -4 -3 -4 -2 -3 -4 -3 -2 -1 -1 -1 0 0 0 2 5 1 0 1
D -4 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -4 -2 -2 -2 -1 0 1 -1 -1 1 6 -2 -1
R -4 -3 -2 -3 -2 -3 -3 -3 -3 -2 -2 -1 -1 -1 0 1 0 -2 6 2
K -4 -3 -2 -3 -2 -3 -3 -3 -2 -1 -1 -1 0 0 -1 1 1 -1 2 5
Lambda = 0.344901, K+ = 0.168203, (K- = 0.119136, C = 0.142262, delta = 1)
Gumbel parameters
| e-value | 0.0001 | 0.001 | 0.01 | 0.1 | 1.0 | 10.0 |
|---|
| score threshold | 81 | 74 | 68 | 61 | 54 | 48 |
|---|
Complementary files