blosumG_20-20_90
# Rectangular BLOSUM Scoring Matrix 20x20 in 1/2 Bit Units
# Blocks Database = blocks.dat
# Cluster Percentage: >= 90
# Entropy = 1.1806, Expected = -0.8887
C F Y W M L I V G P A T S N H Q E D R K
C 9 -3 -4 -4 -2 -2 -2 -2 -4 -4 -1 -2 -2 -4 -5 -4 -6 -5 -5 -4
F -3 7 3 0 -1 0 -1 -2 -5 -4 -3 -3 -3 -4 -2 -4 -5 -5 -4 -4
Y -4 3 8 2 -2 -2 -2 -3 -5 -4 -3 -2 -3 -3 1 -3 -4 -4 -3 -3
W -4 0 2 11 -2 -3 -4 -3 -4 -5 -4 -4 -4 -5 -3 -3 -5 -6 -4 -5
M -2 -1 -2 -2 7 2 1 0 -4 -3 -2 -1 -2 -3 -3 0 -3 -4 -2 -2
L -2 0 -2 -3 2 5 1 0 -5 -4 -2 -2 -3 -4 -4 -3 -4 -5 -3 -3
I -2 -1 -2 -4 1 1 5 3 -5 -4 -2 -1 -3 -4 -4 -4 -4 -5 -4 -4
V -2 -2 -3 -3 0 0 3 5 -5 -3 -1 -1 -2 -4 -4 -3 -3 -5 -3 -3
G -4 -5 -5 -4 -4 -5 -5 -5 6 -3 0 -3 -1 -1 -3 -3 -3 -2 -3 -2
P -4 -4 -4 -5 -3 -4 -4 -3 -3 8 -1 -2 -2 -3 -3 -2 -2 -3 -3 -2
A -1 -3 -3 -4 -2 -2 -2 -1 0 -1 5 0 1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -1
T -2 -3 -2 -4 -1 -2 -1 -1 -3 -2 0 6 1 0 -2 -1 -1 -2 -2 -1
S -2 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -2 -1 -2 1 1 5 0 -2 -1 -1 -1 -1 -1
N -4 -4 -3 -5 -3 -4 -4 -4 -1 -3 -2 0 0 7 0 0 -1 1 -1 0
H -5 -2 1 -3 -3 -4 -4 -4 -3 -3 -2 -2 -2 0 8 1 -1 -2 0 -1
Q -4 -4 -3 -3 0 -3 -4 -3 -3 -2 -1 -1 -1 0 1 7 2 -1 1 1
E -6 -5 -4 -5 -3 -4 -4 -3 -3 -2 -1 -1 -1 -1 -1 2 6 1 -1 0
D -5 -5 -4 -6 -4 -5 -5 -5 -2 -3 -3 -2 -1 1 -2 -1 1 7 -3 -1
R -5 -4 -3 -4 -2 -3 -4 -3 -3 -3 -2 -2 -1 -1 0 1 -1 -3 6 2
K -4 -4 -3 -5 -2 -3 -4 -3 -2 -2 -1 -1 -1 0 -1 1 0 -1 2 6
Lambda = 0.340185, K+ = 0.197246, (K- = 0.140368, C = 0.167198, delta = 1)
Gumbel parameters
| e-value | 0.0001 | 0.001 | 0.01 | 0.1 | 1.0 | 10.0 |
|---|
| score threshold | 83 | 76 | 69 | 62 | 56 | 49 |
|---|
Complementary files