Input sequences
>sp|P04085|PDGFA_HUMAN Platelet-derived growth factor subunit A OS=Homo sapiens GN=PDGFA PE=1 SV=1 MRTLACLLLLGCGYLAHVLAEEAEIPREVIERLARSQIHSIRDLQRLLEIDSVGSEDSLD TSLRAHGVHATKHVPEKRPLPIRRKRSIEEAVPAVCKTRTVIYEIPRSQVDPTSANFLIW PPCVEVKRCTGCCNTSSVKCQPSRVHHRSVKVAKVEYVRKKPKLKEVQVRLEEHLECACA TTSLNPDYREEDTGRPRESGKKRKRKRLKPT
>gi|220840|dbj|BAA00987.1| platelet-derived growth factor A chain (PDGF-A) [Rattus sp.] MRTWACLLLLGCGYLAHALAEEAEIPRELIERLARSQIHSIRDLQRLLEIDSVGAEDALETNLRAHGSHT VKHVPEKRPVPIRRREVLRKPFPQFARPGRSFTRYLGARWTPTSANFLIWPPCVEVKRCTGCCNTSSVKC QPSRVHHRSVKVAKVEYVRKKPKLKEVQVRLEEHLECACATSNLNPDHREEETDVR
Alignment of back-translated graphs
Score: 1518.04
E-value: 0.0
E-value: 0.0
Sequence 1 fragment | Sequence 2 fragment | Reading frame difference | Score | E-value |
---|---|---|---|---|
[1 .. 255] | [1 .. 255] | 0 | 709.44 | 0.0 |
[255 .. 335] | [256 .. 336] | 2 | 142.81 | 4.111543864704359E-6 |
[336 .. 587] | [336 .. 587] | 0 | 785.79 | 0.0 |
M R T W A C L L L L G C G Y L A H A L A E E A E I P R E L I ATGAGAACATGGGCATGTTTATTATTATTAGGATGTGGATATTTAGCACATGCGTTAGCAGAAGAAGCAGAAATACCAAGAGAACTGATA ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||.||||| ATGAGAACATTGGCATGTTTATTATTATTAGGATGTGGATATTTAGCACATGTGTTAGCAGAAGAAGCAGAAATACCAAGAGAAGTGATA M R T L A C L L L L G C G Y L A H V L A E E A E I P R E V I E R L A R S Q I H S I R D L Q R L L E I D S V G A E D A L E GAAAGATTAGCAAGATCACAAATACATTCAATAAGAGATTTACAAAGATTATTAGAAATAGATTCAGTAGGAGCGGAAGATGCGTTAGAA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||. GAAAGATTAGCAAGATCACAAATACATTCAATAAGAGATTTACAAAGATTATTAGAAATAGATTCAGTAGGATCGGAAGATTCGTTAGAT E R L A R S Q I H S I R D L Q R L L E I D S V G S E D S L D T N L R A H G S H T V K H V P E K R P V P I R R R E V L R K ACAAATTTAAGAGCACATGGATCGCATACGGTGAAACATGTACCAGAAAAAAGACCAGTGCCAATAAGAAGA-AGAGAAGTATTGAGGAA ||||:||||||||||||||||.:||||:||::|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||| ||||||||||||||||| ACAAGTTTAAGAGCACATGGAGTGCATGCGACGAAACATGTACCAGAAAAAAGACCACTGCCAATAAGAAGAAAGAGAAGTATTGAGGAA T S L R A H G V H A T K H V P E K R P L P I R R K R S I E E P F P Q F A R P G R S F T R Y L G A R W T P T S A N F L I W GCCGTTCCCGCAGTTTGCAAGACCAGGACGGTCATTTACGAGATACCTAGGAGCCAGGTGGACCCCAACATCAGCAAATTTTTTAATATG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| GCCGTTCCCGCAGTTTGCAAGACCAGGACGGTCATTTACGAGATACCTAGGAGCCAGGTGGAC-CCAACATCAGCAAATTTTTTAATATG A V P A V C K T R T V I Y E I P R S Q V D P T S A N F L I W P P C V E V K R C T G C C N T S S V K C Q P S R V H H R S V GCCACCATGTGTAGAAGTAAAAAGATGTACAGGATGTTGTAATACATCATCAGTAAAATGTCAACCATCAAGAGTACATCATAGATCAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GCCACCATGTGTAGAAGTAAAAAGATGTACAGGATGTTGTAATACATCATCAGTAAAATGTCAACCATCAAGAGTACATCATAGATCAGT P P C V E V K R C T G C C N T S S V K C Q P S R V H H R S V K V A K V E Y V R K K P K L K E V Q V R L E E H L E C A C A AAAAGTAGCAAAAGTAGAATATGTAAGAAAAAAACCAAAATTAAAAGAAGTACAAGTAAGATTAGAAGAACATTTAGAATGTGCATGTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AAAAGTAGCAAAAGTAGAATATGTAAGAAAAAAACCAAAATTAAAAGAAGTACAAGTAAGATTAGAAGAACATTTAGAATGTGCATGTGC K V A K V E Y V R K K P K L K E V Q V R L E E H L E C A C A T S N L N P D H R E E E T D AACATCGAATTTAAATCCAGATCACAGAGAAGAAGAAACAGAC ||||.|||:|||||||||||||:|||||||||||||.||||:| AACAACGAGTTTAAATCCAGATTACAGAGAAGAAGATACAGGC T T S L N P D Y R E E D T G
Protein alignment
PDGFA_HUMAN 1 MRTLACLLLLGCGYLAHVLAEEAEIPREVIERLARSQIHSIRDLQRLLEI 50 |||.|||||||||||||.||||||||||:||||||||||||||||||||| BAA00987.1 1 MRTWACLLLLGCGYLAHALAEEAEIPRELIERLARSQIHSIRDLQRLLEI 50 PDGFA_HUMAN 51 DSVGSEDSLDTSLRAHGVHATKHVPEKRPLPIRRKRSIEEAVPAVCKTRT 100 ||||:||:|:|:|||||.|..||||||||:||||:..:.:..|...:... BAA00987.1 51 DSVGAEDALETNLRAHGSHTVKHVPEKRPVPIRRREVLRKPFPQFARPGR 100 PDGFA_HUMAN 101 VIYEIPRSQVDPTSANFLIWPPCVEVKRCTGCCNTSSVKCQPSRVHHRSV 150 .......::..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| BAA00987.1 101 SFTRYLGARWTPTSANFLIWPPCVEVKRCTGCCNTSSVKCQPSRVHHRSV 150 PDGFA_HUMAN 151 KVAKVEYVRKKPKLKEVQVRLEEHLECACATTSLNPDYREEDT 193 |||||||||||||||||||||||||||||||::||||:|||:| BAA00987.1 151 KVAKVEYVRKKPKLKEVQVRLEEHLECACATSNLNPDHREEET 193