Présentation

Les journées SeqBio sont les journées francophones annuelles communes au GDR BIM (bioinformatique moléculaire) et au groupe COMATEGE du GDR IM (informatique mathématique). Cette réunion s’adresse aux chercheurs en informatique, statistique, bio-informatique et biologie qui travaillent sur les séquences, vues comme objet combinatoire ou comme objet biologique.

Ces journées sont organisées annuellement et ont eu lieu les années précédentes à Nantes, Orsay, Montpellier.

Comme chaque année depuis 2011, nous aurons des orateurs invités. Cette année il s'agira de Knut Reinert de l'université libre de Berlin ainsi que Céline Scornavacca, CNRS, ISEM, Montpellier.

Les thématiques abordées sont les suivantes :
  • combinatoire des mots, statistiques sur les mots
  • algorithmique du texte, structures d'indexation
  • algorithmique parallèle
  • recherche, découverte et analyse de motifs et de répétitions
  • analyse des données de séquençage haut-débit (génomique, métagénomique, RNA-seq, ...)
  • annotation des génomes, prédiction de gènes
  • haplotypes et polymorphismes
  • génomique comparative
  • signaux de regulation

Dates limites

Soumissions

Les soumissions se font via EasyChair au format PDF.

Deux types de soumissions sont acceptés : résumé court (≤ 2 pages) ou étendu (il n'y a pas de limite ferme mais de préférence ≤ 8 pages). Des modèles LaTeX ou traitement de texte sont disponibles. Le texte peut être rédigé en français ou en anglais. Pour les présentations, toutefois, il serait bienvenu que, par bienveillance envers les orateurs non francophones, les transparents soient en anglais.

Informations pratiques

Vous pouvez trouver une liste d'hôtels disponibles sur le site de l'office de tourisme de Lille

Les journées se tiendront sur le campus de l'université Lille 1, à Villeneuve d'Ascq, dans l'amphithéâtre Migeon du bâtiment Polytech'Lille.

Pour venir sur le campus, le plus simple est de venir en métro en prenant la ligne 1, jusqu'au terminus 4 cantons (compter au total 30 minutes depuis la gare Lille Flandres).

Plan du métro à Polytech

L'arrêt de métro se trouve à l'endroit du marqueur vert, en bas de la carte, et l'entrée du bâtiment Polytech se trouve au niveau du marqueur rouge, en haut

Programme

Le programme sera composé une fois les résumés soumis et acceptés.

Nous aurons deux exposés invités :

Inscription

Les inscriptions sont gratuites mais obligatoires.

Comité d'organisation

Rayan Chikhi CNRS, CRIStAL, Université de Lille
Stéphane Janot CRIStAL, Université de Lille
Laurent Noé CRIStAL, Université de Lille
Mikaël SalsonCRIStAL, Université de Lille
Hélène TouzetCNRS, CRIStAL, Université de Lille

Comité scientifique

Rayan ChikhiCNRS, CRIStAL, Université de Lille
Alain DeniseLRI et IGM, Université Paris-Sud
Vincent LacroixLBBE, Université Lyon 1
Thierry LecroqLITIS, Université de Rouen
Laurent NoéCRIStAL, Université de Lille
Irena RusuLINA, Université de Nantes
Mikaël SalsonCRIStAL, Université de Lille
Hélène TouzetCNRS, CRIStAL, Université de Lille
Raluca UricaruLaBRI, Université de Bordeaux
Stéphane VialetteCNRS, LIGM, Université Paris Est

Soutiens

GDR BiM

GDR IM

CRIStAL

Polytech'Lille