blosumG_16-20_60
# Rectangular BLOSUM Scoring Matrix 16x20 in 1/3 Bit Units
# Blocks Database = blocks.dat
# Cluster Percentage: >= 60
# Entropy = 0.6390, Expected = -0.4826
C F Y W M L I V G P A T S N H Q E D R K
C 13 -3 -4 -3 -2 -2 -2 -1 -4 -4 0 -1 -1 -4 -4 -4 -5 -5 -5 -5
FY -3 8 7 2 0 0 -1 -1 -4 -5 -3 -3 -3 -4 0 -3 -4 -5 -3 -4
W -3 1 3 16 -2 -2 -4 -4 -3 -5 -4 -4 -4 -5 -3 -3 -4 -6 -4 -4
ML -2 1 -1 -2 4 5 2 1 -5 -4 -2 -2 -3 -4 -3 -2 -4 -5 -3 -3
IV -2 -1 -2 -4 1 2 5 5 -5 -4 -1 0 -3 -4 -5 -4 -4 -4 -4 -4
G -4 -5 -4 -3 -4 -5 -5 -5 8 -3 0 -2 0 0 -3 -3 -3 -2 -3 -2
P -4 -5 -4 -5 -4 -4 -4 -3 -3 11 -1 -2 -1 -3 -3 -2 -2 -2 -3 -1
A 0 -3 -2 -4 -1 -2 -2 0 0 -1 6 0 2 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -1
T -1 -3 -2 -4 -1 -2 -1 0 -2 -2 0 7 2 0 -2 -1 -1 -1 -2 -1
S -1 -3 -3 -4 -2 -4 -3 -2 0 -1 2 2 6 1 -1 0 0 0 -1 0
N -4 -4 -3 -5 -3 -5 -4 -4 0 -3 -2 0 1 8 1 0 0 2 -1 0
H -4 -2 2 -3 -2 -4 -5 -5 -3 -3 -2 -2 -1 1 11 1 0 -1 0 -1
QE -5 -5 -3 -3 -2 -4 -4 -3 -3 -2 -1 -1 0 0 0 5 6 2 1 2
D -5 -5 -4 -6 -5 -5 -4 -5 -2 -2 -3 -1 0 2 -1 0 2 9 -2 -1
R -5 -4 -2 -4 -2 -3 -4 -4 -3 -3 -2 -2 -1 -1 0 1 0 -2 8 3
K -5 -4 -3 -4 -2 -4 -4 -3 -2 -1 -1 -1 0 0 -1 2 1 -1 3 7
Lambda = 0.223766, K+ = 0.132667, (K- = 0.106068, C = 0.118872, delta = 1)
Gumbel parameters
e-value | 0.0001 | 0.001 | 0.01 | 0.1 | 1.0 | 10.0 |
---|
score threshold | 124 | 114 | 104 | 93 | 83 | 73 |
---|
Complementary files