blosumG_20-20_100
# Rectangular BLOSUM Scoring Matrix 20x20 in 1/2 Bit Units
# Blocks Database = blocks.dat
# Cluster Percentage: >= 100
# Entropy = 1.4516, Expected = -1.0948
C F Y W M L I V G P A T S N H Q E D R K
C 9 -3 -4 -5 -3 -3 -2 -2 -5 -5 -1 -2 -2 -4 -5 -5 -6 -5 -5 -5
F -3 7 3 0 -1 0 -1 -2 -5 -5 -4 -3 -3 -5 -2 -4 -5 -5 -4 -4
Y -4 3 8 1 -3 -3 -3 -3 -6 -5 -4 -3 -3 -3 1 -3 -4 -5 -3 -4
W -5 0 1 11 -3 -4 -4 -4 -5 -6 -4 -5 -4 -6 -3 -3 -5 -7 -4 -5
M -3 -1 -3 -3 8 2 1 0 -5 -4 -2 -2 -3 -4 -3 -1 -4 -5 -2 -2
L -3 0 -3 -4 2 5 1 0 -5 -4 -3 -3 -4 -5 -4 -3 -5 -6 -4 -4
I -2 -1 -3 -4 1 1 5 2 -6 -4 -3 -2 -4 -5 -5 -4 -5 -6 -4 -4
V -2 -2 -3 -4 0 0 2 5 -5 -4 -1 -1 -3 -4 -5 -3 -3 -5 -4 -4
G -5 -5 -6 -5 -5 -5 -6 -5 6 -4 -1 -3 -1 -2 -4 -3 -4 -3 -4 -3
P -5 -5 -5 -6 -4 -4 -4 -4 -4 8 -1 -3 -2 -4 -3 -2 -3 -3 -3 -2
A -1 -4 -4 -4 -2 -3 -3 -1 -1 -1 5 -1 1 -2 -3 -1 -2 -3 -2 -2
T -2 -3 -3 -5 -2 -3 -2 -1 -3 -3 -1 6 1 -1 -3 -2 -2 -2 -2 -2
S -2 -3 -3 -4 -3 -4 -4 -3 -1 -2 1 1 6 0 -2 -1 -1 -1 -2 -1
N -4 -5 -3 -6 -4 -5 -5 -4 -2 -4 -2 -1 0 7 0 -1 -1 1 -1 -1
H -5 -2 1 -3 -3 -4 -5 -5 -4 -3 -3 -3 -2 0 9 0 -1 -2 -1 -2
Q -5 -4 -3 -3 -1 -3 -4 -3 -3 -2 -1 -2 -1 -1 0 7 1 -2 0 1
E -6 -5 -4 -5 -4 -5 -5 -3 -4 -3 -2 -2 -1 -1 -1 1 6 1 -2 0
D -5 -5 -5 -7 -5 -6 -6 -5 -3 -3 -3 -2 -1 1 -2 -2 1 7 -3 -2
R -5 -4 -3 -4 -2 -4 -4 -4 -4 -3 -2 -2 -2 -1 -1 0 -2 -3 7 2
K -5 -4 -4 -5 -2 -4 -4 -4 -3 -2 -2 -2 -1 -1 -2 1 0 -2 2 6
Lambda = 0.358511, K+ = 0.225042, (K- = 0.157240, C = 0.189120, delta = 1)
Gumbel parameters
| e-value | 0.0001 | 0.001 | 0.01 | 0.1 | 1.0 | 10.0 |
|---|
| score threshold | 79 | 72 | 66 | 60 | 53 | 47 |
|---|
Complementary files